Cell | 免疫疾病中吞噬细胞特异基因调控动态全景图

2022-01-03 04:28:43 来源:
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韩国东京大学的学术研究技术人员和RIKEN Research学术研究院的合编者们已经设立了首个针对自身免疫反应性病症和自身瘙痒性病症的等位基因资料库。期盼这一自然资源能为免疫反应病症的演进提供新的论调,并似乎更容易药物的挖掘出。学术研究团队们还期盼,与免疫反应系统性的等位基因信息记事最终似乎应用领域诸如COVID-19等霍乱的学术研究。

韩国东京大学项目学术研究助理,临床研究风湿病学家,功用等位基因学研究员Mineto OtaClark话说:“要认识到病症,就需要深刻理解等位基因变异的功用。有了这个信息集,我们就可以将与病症系统性的DNA序列波动的信息与对病症发病机制颇为重要的等位基因和肝细胞型式连系起来。”Ota是该团队出版在《Cell》Magazine上的出版文章的主要编者,出版文章曲名为“Dynamic landscape of immune cell-specific gene regulation in immune-mediated diseases”。该项目是与Chugai Pharmaceutical的学术研究团队们合作来进行的。

编者所写,免疫反应酪氨酸的病症(IMD)之外从自身免疫反应性到自身瘙痒的多种病理。他们引述,尽管IMD里炎性肝细胞因子的异常社交活动暗示免疫反应肝细胞功用发生了波动,但是,“对于IMD的系统性等位基因甚至系统性肝细胞型式知之甚少。”

同类型等位基因关连学术研究(GWAS)挖掘出了许多与IMD系统性的等位基因位点。但是,在此类关连学术研究里鉴定造出的许多等位基因变异都坐落平衡等位基因“on”或“off”表达出来的DNA非编码方式周围,而不是坐落等位基因编码方式序列里。学术研究团队引述:“GWAS已经揭示了许多与繁杂子代和病症系统性的等位基因位点,之外IMD。这些变异里的大多数都坐落非编码方式等位基因周围,尤其是催化反应电路,如增强子和启动子。”

为了揭示催化反应DNA的功用,一种有所不同型式的等位基因量化,称之为表达出来定量子代等位基因位点(eQTL),意在将DNA序列的差异与等位转录出来的差异连系起来。借助eQTL信息,学术研究技术人员可以对催化反应DNA序列的目的、催化反应序列里的变异如何冲击其催化反应等位基因的表达出来以及这些等位转录出来差异如何导致病症做造出更理应的并不知道。

其它针对免疫反应的eQTL学术研究已经在来进行里,但之前的学术研究工作只之外卫生自愿者,并安同类型检查了依赖于数量的肝细胞型式。学术研究技术人员所写:“对卫生供体免疫反应肝细胞的学术研究似乎未能捉到病症长时间下挖掘出的一系列eQTL物理现象。此外,虽然对免疫反应肝细胞的实验性诱因可以在某种程度上模拟病症长时间,但并不也许体现造出体内的生物体环境。”

Ota缺少道:“瘙痒长时间下,免疫反应肝细胞的电学适应性与卫生长时间下的有所有所不同肝细胞截然有所不同。与免疫反应原因系统性的等位基因变异似乎只在患病长时间下起抑制作用,因此对于这种型式的等位基因学术研究,从真实病征身上获取抽取颇为重要。”

在他们最近引述的学术研究里,学术研究团队对79名卫生自愿者和337名被病因患有10种有所不同型式免疫反应酪氨酸病症(之外类风湿性关节炎、持续性红斑狼疮和持续性硬化症)的病征来进行了同类型等位基因高通量。所有自愿者都是韩国血统。

认识到免疫反应酪氨酸的病症不具挑战性,因为尽管每种病症在临床研究上都是有所不同的,但仍有许多重叠之处,并且不具有所有所不同病因的病征似乎会表现造出颇为有所不同的症状。学术研究技术人员缺少话说:“由于所有这些社会性,一次深造一种免疫反应酪氨酸病症的能力是依赖于的。但是,如果我们两兄弟学术研究10种病症,就可以更下半年地认识到这些型式的病症。”

在完毕同类型等位基因高通量后,学术研究技术人员从自愿者的血液抽取里分离造出28种有所不同型式的免疫反应系统性肝细胞,并测量了这些肝细胞里的等位转录出来。“我们在记事里看到,每种免疫反应肝细胞型式都有有所不同的eQTL结果,这可以告知我们肝细胞型式密切关系等位基因催化反应的差异,以及哪种肝细胞型式对于演进哪种病症至关重要。”学术研究技术人员话说。

编者分析报告话说,“在等位转录出来量化里,我们在一个平台上对多个IMD来进行比较,使我们都能详细描述每个病症(病征)的形态,并辨识与单个病症特异性系统性的等位基因,以及在一组IMD里亢进的自营……我们的信息集使我们都能检测每个特定肝细胞型式里eQTL物理现象的生物体(病症)背景驱动的分心。”

学术研究技术人员将获得的自然资源命名为韩国东京大学免疫反应肝细胞等位转录出来记事(ImmuNexUT),并话说它代表了使用东亚地区血统自愿者设立的最大的eQTL信息集。他们概述道:“我们考虑到了免疫反应肝细胞型式特异性的eQTL物理现象,之外以前未引述的罕见肝细胞型式,它们在生物体瘙痒条件下的社会性,以及这些eQTL与IMD遗传密切关系的显著关连。”

“到目前为止,在这一领域,大规模的等位基因和功用等位基因学术研究主要是借助欧洲**来进行的,尽管群体社会性对于精确理解等位基因功用至关重要。”学术研究技术人员话说,“这个韩国受试者的eQTL记事对于解决问题这种以欧洲为为里心的性别歧视,混合欧洲的信息集进一步学术研究DNA变异的功用,也不具重要内涵。”

学术研究技术人员期盼ImmuNexUT资料库将继续快速增长,并最终为病征随之而来更好的结果。他们话说:“与在此之前引述的自然资源相比之下,我们的信息集不具与众不同而有利的特点,之外下半年的免疫反应肝细胞可分、**密切关系免疫反应原因的波动以及同质的非欧洲**。”

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